86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3879 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 359 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  88.58 
 
 		 359 aa  630  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  60.45 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  53.37 
 
 		 370 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  52.5 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  53.33 
 
 		 360 aa  348  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.4 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  31.87 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  27.89 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  27.65 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  32.97 
 
 		 780 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  30.32 
 
 		 631 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  31.72 
 
 		 779 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  31.76 
 
 		 407 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 779 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  28.12 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  29.76 
 
 		 704 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  26.29 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  29.96 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  25.51 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1676 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  29.22 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.92 
 
 		 865 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.36 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  26.5 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.95 
 
 		 875 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.59 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 542 aa  56.2  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  26.84 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  26.84 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  24.83 
 
 		 518 aa  50.4  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 494 aa  50.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 		 238 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  28.16 
 
 		 523 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.69 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.69 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 155 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.97 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.61 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0839  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.94 
 
 		 238 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.14 
 
 		 238 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  32.73 
 
 		 199 aa  47  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.62 
 
 		 246 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  27.55 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.97 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.84 
 
 		 260 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.93 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 268 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.4 
 
 		 246 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.31 
 
 		 240 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 239 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.56 
 
 		 245 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  24.02 
 
 		 514 aa  43.1  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 232 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 232 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 1143 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 264 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>