94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1065 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  100 
 
 
360 aa  716    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  60.45 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  59.89 
 
 
359 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  56.67 
 
 
360 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  53.65 
 
 
370 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  53.89 
 
 
360 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.8 
 
 
395 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
390 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  32.67 
 
 
399 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  32.81 
 
 
399 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 
400 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  29.88 
 
 
403 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 
400 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  31.02 
 
 
631 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.2 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  35.2 
 
 
704 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25.59 
 
 
779 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
779 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  28.83 
 
 
400 aa  85.9  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  33.14 
 
 
780 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  28.57 
 
 
407 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  27.05 
 
 
580 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  23.67 
 
 
653 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.46 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.45 
 
 
875 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.21 
 
 
865 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
441 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  25.09 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  30.68 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
661 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  28.79 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.07 
 
 
1676 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  27.89 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 
440 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
267 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
268 aa  56.6  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  30.15 
 
 
542 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  26.35 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  26.25 
 
 
441 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 
441 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.35 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.14 
 
 
245 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  25.94 
 
 
518 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  22.15 
 
 
494 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 
237 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 
237 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  22.27 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  25.68 
 
 
523 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.77 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  30.86 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.77 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.1 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  26.89 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  29.01 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
238 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
246 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0839  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.18 
 
 
238 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.54 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  26.55 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0495  methyltransferase type 12  26.14 
 
 
273 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.01 
 
 
235 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.85 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.91 
 
 
155 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  27.85 
 
 
261 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.85 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.85 
 
 
261 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  27.85 
 
 
261 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.85 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
271 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5458  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
239 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112293  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  20.94 
 
 
514 aa  43.5  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
264 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  31.21 
 
 
365 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.93 
 
 
232 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  30.1 
 
 
199 aa  42.7  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
363 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  29 
 
 
266 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
238 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
238 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.18 
 
 
229 aa  42.7  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>