More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2179 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2179  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 209 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 1000 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.45 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.08 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.87 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.9 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.9 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.45 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.82 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.45 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 1002 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.01 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.6 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  35.15 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 1005 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.45 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  29.52 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.82 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  34.34 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  35 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.61 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.68 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  33.92 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.57 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 1039 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  27.67 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 624 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  32.28 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.56 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  29.56 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.97 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  32.41 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.19 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.27 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  34 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  32.53 
 
 		 1014 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  33.76 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  29.22 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  25.99 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  28.86 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2683  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.11 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>