237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1203 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1203  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0298  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  37.6 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  35.2 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.64 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  36.8 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  32.73 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  27.05 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  27.05 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  27.05 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  28.33 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2332  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.18 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000815001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  27.87 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  24.56 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  28.57 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  22.05 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  28 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  23.28 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0605  hypothetical protein  20.69 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  29.84 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 298 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  31.86 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  24.83 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  23.91 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  24.71 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  23.81 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  24.75 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  23.68 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  26.67 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  21.55 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  17.65 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.52 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.32 
 
 		 351 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  25.42 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.67 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  32 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  26.67 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  26.67 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  23.81 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.46 
 
 		 299 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  23.58 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  25.74 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  21.64 
 
 		 304 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 328 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.6 
 
 		 310 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  26.67 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  24.35 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.87 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  26.15 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.42 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0680  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.7 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  26.32 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  24.51 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  28.16 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  31.78 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  23.48 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 710 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 328 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  29.6 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.29 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.57 
 
 		 345 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21.14 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  26.92 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.42 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.18 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  25.69 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.66 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.62 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  28.78 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>