247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2762 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  100 
 
 
214 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  52.34 
 
 
214 aa  228  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4739  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.673434  hitchhiker  0.00496739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1520  hypothetical protein  31.91 
 
 
206 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685504  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1200  hypothetical protein  30.66 
 
 
206 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0646  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347326  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3095  hypothetical protein  32.22 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0190  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.561898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.07 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  39.29 
 
 
415 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3642  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
355 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000500593  decreased coverage  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.84 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  25.88 
 
 
262 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  38.1 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  33.94 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.21 
 
 
200 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
299 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0218  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  34.44 
 
 
783 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1203  hypothetical protein  23.81 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  31.3 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  24.49 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  28.87 
 
 
268 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
637 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
331 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  26.03 
 
 
263 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
314 aa  48.9  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  33.03 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
341 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  33.03 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4424  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203515  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.22 
 
 
345 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
332 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  33.73 
 
 
292 aa  48.5  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  26.32 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.43 
 
 
258 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3277  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
260 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
254 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  26.98 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.77 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0764  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0487  methyltransferase type 11  23.31 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
304 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  32.11 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  28.18 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  31.31 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  32 
 
 
327 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  21.54 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  21.05 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
217 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1967  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
205 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.73 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.03 
 
 
251 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
194 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  30.85 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  29.51 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  24.54 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  26 
 
 
352 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  25 
 
 
165 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  30.43 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  27.62 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  28.16 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  32.11 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.33 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  25.55 
 
 
287 aa  45.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  26.21 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  26.21 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  30.21 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
634 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  30.28 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  28.03 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>