222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2231 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  100 
 
 		 214 aa  443  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  52.34 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4739  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.673434  hitchhiker  0.00496739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1520  hypothetical protein  33.64 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1200  hypothetical protein  31.77 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0646  hypothetical protein  30.73 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3095  hypothetical protein  32.45 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0190  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.561898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  29.17 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1203  hypothetical protein  26.67 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  27.55 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3277  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0218  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  26.7 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.23 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 302 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  25 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.3 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  31.65 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3642  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 355 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000500593  decreased coverage  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  34.04 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 363 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.78 
 
 		 351 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.91 
 
 		 299 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 268 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 268 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  25.66 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  31.58 
 
 		 351 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  21.86 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 345 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.47 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 390 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1204  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.602867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  30.21 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  26.9 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.78 
 
 		 262 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  30.21 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.21 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  36.96 
 
 		 415 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  34.88 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30.21 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30.21 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0598  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 293 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  31.87 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  28.23 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  23.48 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  30.21 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 285 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  25.97 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  25.97 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 417 aa  45.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.07 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 276 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  32.89 
 
 		 268 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  26.12 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  24.82 
 
 		 559 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  28 
 
 		 363 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  24.27 
 
 		 363 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.67 
 
 		 261 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>