38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1467 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6798  putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  75.22 
 
 		 234 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0956  methyltransferase type 12  74.89 
 
 		 231 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  78.7 
 
 		 231 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2873  methyltransferase type 12  74.35 
 
 		 241 aa  348  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2448  hypothetical protein  69.16 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3835  methyltransferase type 12  76.62 
 
 		 231 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  48.46 
 
 		 242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3532  methyltransferase type 12  43.86 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  43.52 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  33.64 
 
 		 1914 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  27.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  27.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  27.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  27.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  27.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  27.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  27.22 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  27.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  27.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  44 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0215  Methyltransferase type 12  26.81 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.647581 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  28.38 
 
 		 3761 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  27.91 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 247 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 247 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 220 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  44 
 
 		 266 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 250 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.5 
 
 		 318 aa  41.6  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>