64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3532 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3532  methyltransferase type 12  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0956  methyltransferase type 12  42.98 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2873  methyltransferase type 12  42.04 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6798  putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.04 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2448  hypothetical protein  42.11 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  43.81 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  47.25 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  41.59 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3835  methyltransferase type 12  45.13 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  33.88 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  34.17 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  31.85 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  30.6 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  31.85 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 358 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  32.5 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.07 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 		 350 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.73 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  30.37 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  31.88 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  39.05 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 		 1001 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  24.74 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  29.66 
 
 		 2012 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  28.57 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  23.75 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.58 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.8 
 
 		 442 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.1 
 
 		 457 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.83 
 
 		 3639 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.49 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  29.2 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.93 
 
 		 256 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  29.59 
 
 		 427 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  28.46 
 
 		 193 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 238 aa  42  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>