14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2873 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2873  methyltransferase type 12  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2448  hypothetical protein  81.25 
 
 		 284 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0956  methyltransferase type 12  78.41 
 
 		 231 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  74.35 
 
 		 231 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6798  putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  72.61 
 
 		 234 aa  347  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  73.48 
 
 		 231 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3835  methyltransferase type 12  73.48 
 
 		 231 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  47.39 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3532  methyltransferase type 12  42.04 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  43.06 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  34.78 
 
 		 1914 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  29.36 
 
 		 2012 aa  41.6  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>