19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1765 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1765  methyltransferase type 11  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.751788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0896  methyltransferase type 11  63.81 
 
 		 269 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  25 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0215  Methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.647581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  25.15 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 307 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.12 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1554  hypothetical protein  25.88 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  23.57 
 
 		 199 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 269 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>