165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1457 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1457  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.08 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.81 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.81 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.82 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28.07 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  25.16 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  22.56 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.24 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.06 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.43 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  26.4 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  26.4 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  26.4 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  23.31 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.6 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.37 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  27.03 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.12 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3585  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 294 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.21 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  28.07 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1386  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1420  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.73 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  30.09 
 
 		 179 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.6 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  24.46 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  28.44 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.55 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1085 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.73 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 436 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2749  Methyltransferase type 11  24.09 
 
 		 471 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.46 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  27.35 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  27.2 
 
 		 290 aa  45.1  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.41 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 1106 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  41.07 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  24.19 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.38 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  44.64 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.17 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  46.15 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  23.28 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.7 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  26.67 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  25 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  26.42 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  26.98 
 
 		 652 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.7 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.26 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.02 
 
 		 421 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  25.47 
 
 		 646 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>