161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0768 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0768  methyltransferase type 12  100 
 
 
222 aa  460  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1703  hypothetical protein  24.55 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  25.89 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  25.85 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30 
 
 
251 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  32.08 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.82 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  27.08 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.93 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.93 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
195 aa  52  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
257 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  30.58 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  26.62 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0349  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  24.04 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.09 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  25.15 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.87 
 
 
269 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0356  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
274 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
244 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.04 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.19 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.66 
 
 
7785 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  34.52 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  30 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  24.74 
 
 
242 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  27.87 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.63 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
996 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.2 
 
 
262 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  23.95 
 
 
237 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.5 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 
254 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.85 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
279 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 
152 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.11 
 
 
258 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1326  methyltransferase  31.11 
 
 
258 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.38 
 
 
315 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  25 
 
 
4483 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 
1288 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
442 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  28.99 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.63 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
257 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  31.31 
 
 
251 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  25.64 
 
 
2012 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  25.83 
 
 
198 aa  45.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.27 
 
 
258 aa  45.1  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.86 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.11 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  28.87 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  20.59 
 
 
390 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  25.35 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.11 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
2490 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
267 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.27 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  28.87 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  26.98 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.11 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  24.65 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  29.91 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  35.23 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.11 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  28.35 
 
 
325 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  33.85 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  31.63 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.98 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2156  methyltransferase type 12  43.66 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.29498  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.71 
 
 
260 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  30.3 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  29.7 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>