43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0019 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  45.59 
 
 		 240 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  45.81 
 
 		 502 aa  147  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  36.92 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  39.5 
 
 		 462 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  40.3 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  39.3 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  44.61 
 
 		 464 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  35.38 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  35.5 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  36.87 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  36.6 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  38.42 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  41.61 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  36.65 
 
 		 464 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  35.05 
 
 		 195 aa  118  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  33.52 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  33.52 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  34.39 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  32.97 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  35.29 
 
 		 471 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 265 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  36.96 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  33.33 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  39.46 
 
 		 427 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  37.24 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  36.73 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  35.15 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  37.82 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  38.46 
 
 		 708 aa  92.4  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  36.09 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  34.12 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  31.72 
 
 		 447 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  36.97 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  32.76 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 1001 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 1015 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  34.55 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  34.55 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.09 
 
 		 227 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 252 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 241 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>