72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2920 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 195 aa  407  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  42.63 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  43.68 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  42.55 
 
 		 462 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  43.39 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  43.62 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  43.16 
 
 		 198 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  42.63 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  42.55 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  44.2 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  43.16 
 
 		 502 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  45.62 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  42.78 
 
 		 464 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  41.27 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  46.15 
 
 		 464 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  40.84 
 
 		 447 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  39.47 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  45.1 
 
 		 471 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  39.8 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  40.88 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  38.78 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  41.88 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  37.08 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  42.14 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  41.51 
 
 		 199 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  40.11 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  41.25 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  32.7 
 
 		 265 aa  124  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  37.1 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  41.25 
 
 		 708 aa  121  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  35.75 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  35.05 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  34.72 
 
 		 427 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 1015 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  30.07 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  31.66 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  28.66 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  28.66 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 1001 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 327 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 260 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  34.75 
 
 		 302 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 349 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 354 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 272 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 339 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 		 328 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0062  methyltransferase  26 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.48034  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.35 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.78 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  23.86 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  24.68 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  27.45 
 
 		 344 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  26.52 
 
 		 2012 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 315 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>