257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2507 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  86.97 
 
 
302 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  51.98 
 
 
257 aa  255  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  51.19 
 
 
262 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1652  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  35.38 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  27.98 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.91 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.71 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  27.38 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  27.38 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  27.38 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  27.38 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  27.38 
 
 
229 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  27.38 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
802 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.09 
 
 
247 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
996 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  27.38 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  35.25 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.19 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.09 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  33.67 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  27.38 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 
238 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
215 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4005  hypothetical protein  33.91 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.151604  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  28.16 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.23 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  25.15 
 
 
228 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.64 
 
 
330 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.64 
 
 
345 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
267 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  30.29 
 
 
217 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  27.53 
 
 
249 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  33.61 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.4 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.58 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.01 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.11 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.11 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  30.66 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  25.6 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
265 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  27.42 
 
 
226 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.69 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
298 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  32.61 
 
 
233 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  34.71 
 
 
197 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  32.38 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
1162 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.03 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
689 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  25 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  26.22 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.5 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2417  hypothetical protein  35.94 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.320398  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  30.29 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.08 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  27.01 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.9 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  30.89 
 
 
353 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.03 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
353 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
1312 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  30.63 
 
 
332 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  35.63 
 
 
221 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  23.7 
 
 
215 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
234 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  30.33 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 
235 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>