95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1983 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  81.48 
 
 		 190 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  40.74 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  36.6 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  28.66 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  35.95 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  37.5 
 
 		 471 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  38.46 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  41.25 
 
 		 447 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  34.19 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  34.31 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  35.19 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  35.45 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  30.83 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  37.61 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  38.89 
 
 		 502 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  34.83 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  34.34 
 
 		 4483 aa  54.7  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  36.67 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  35 
 
 		 464 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  37.76 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  35.56 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  35.56 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  33.33 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  35.54 
 
 		 2997 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  37.8 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  37.04 
 
 		 1914 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 472 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  36.26 
 
 		 6999 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1473  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.71 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.103865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1128  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.46 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.94 
 
 		 255 aa  48.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  31.87 
 
 		 464 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  35.29 
 
 		 427 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  41.56 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1672  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.71 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.66 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.69 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  32.05 
 
 		 2012 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.33 
 
 		 2867 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3924  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.68 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2602  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.36 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.56 
 
 		 262 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  41.98 
 
 		 1140 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0720096  normal  0.188853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1666  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  30.3 
 
 		 233 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  35.54 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.83 
 
 		 264 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  36.14 
 
 		 8211 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.89 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 246 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  36.59 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  35.54 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.8 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.05 
 
 		 7541 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 255 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  32.38 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  39.51 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2437  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.31 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  24.11 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.41 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.65 
 
 		 444 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  34.44 
 
 		 192 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  39.78 
 
 		 236 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 248 aa  42  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.95 
 
 		 298 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  34.55 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.78 
 
 		 265 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3677  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  27.18 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.95 
 
 		 298 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  30 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  26.5 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  30.15 
 
 		 269 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  35.78 
 
 		 222 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 239 aa  41.2  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  36.78 
 
 		 237 aa  41.2  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 230 aa  41.2  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 283 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  29.91 
 
 		 217 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  33.01 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>