138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1800 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  100 
 
 		 286 aa  593  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  41.46 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  39.04 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  37.6 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  37.7 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  35 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  32.79 
 
 		 253 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  35 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  35 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  36.32 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  33.47 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  34.26 
 
 		 462 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  33.18 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  26.97 
 
 		 502 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  29.48 
 
 		 471 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  31.02 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  28.75 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  29.13 
 
 		 464 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  30.14 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  27.78 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  29.22 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  30.27 
 
 		 193 aa  89.7  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0905  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  89  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  29.2 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  30.63 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  29.22 
 
 		 245 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  29.82 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  31.84 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  28.4 
 
 		 708 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  27.78 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  30.17 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  27.75 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  25 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  31.09 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  29.41 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  27 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  29.41 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  30.2 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  29.53 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  25.79 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  28.5 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  26.97 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  26 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  25.24 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  24.81 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  27.41 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.43 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  24.6 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  30.41 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  51.22 
 
 		 642 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  27.18 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  25 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.79 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  24.87 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  28.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.89 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  25.6 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.74 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  28.57 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.94 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  25.29 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  34.81 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  23.98 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  21.72 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  26.78 
 
 		 693 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  33.82 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  29.32 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.57 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  27.37 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  36.67 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  26.4 
 
 		 220 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  26.4 
 
 		 220 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  21.29 
 
 		 487 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.56 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  31.4 
 
 		 124 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  26.4 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  24.1 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  28.57 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  25.43 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  23.23 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  26.06 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.47 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.79 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.85 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  23.2 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  31.62 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  25.77 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.07 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  47.37 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  25.74 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  21.23 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  29.1 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  29.1 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.85 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.08 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  29.85 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  25.78 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>