71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1431 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  56.73 
 
 		 487 aa  124  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  49.49 
 
 		 693 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  42 
 
 		 469 aa  93.2  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  43.14 
 
 		 337 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  45 
 
 		 300 aa  87.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  44.44 
 
 		 316 aa  84.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  42 
 
 		 322 aa  81.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  35.64 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  36.73 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  36.63 
 
 		 288 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  33.66 
 
 		 265 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  34.65 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  39.36 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  37.63 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  36.46 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  36.79 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  35.48 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  37.23 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  35.48 
 
 		 447 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  35.56 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  34.38 
 
 		 193 aa  52  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  32.67 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  38.36 
 
 		 708 aa  52  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.41 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  37.89 
 
 		 302 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  28.1 
 
 		 670 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  28.1 
 
 		 642 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  35.87 
 
 		 464 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  30.53 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.41 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.41 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  31.4 
 
 		 286 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  32.98 
 
 		 427 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  53.66 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  30.93 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  31.58 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  34.31 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  31.18 
 
 		 252 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  29.7 
 
 		 239 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  32 
 
 		 270 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.05 
 
 		 637 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  46.34 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.35 
 
 		 236 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  35.11 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.72 
 
 		 237 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  32 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  31.11 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.5 
 
 		 642 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  32.67 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  34.04 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  48.72 
 
 		 502 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  29.63 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  30.34 
 
 		 261 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  29.03 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  47.5 
 
 		 228 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  44.74 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  28.87 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  31.73 
 
 		 258 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.4 
 
 		 646 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  42.55 
 
 		 258 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  30.77 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  25.64 
 
 		 245 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_002950  PG1285  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25 
 
 		 655 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  27.36 
 
 		 250 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  32.61 
 
 		 240 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  32.67 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  41.03 
 
 		 462 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  31 
 
 		 316 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  27.52 
 
 		 257 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.39 
 
 		 637 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>