99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0814 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  62.13 
 
 		 300 aa  355  5e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  58.17 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  32.59 
 
 		 487 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  36.67 
 
 		 693 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  32.33 
 
 		 469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  35.04 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  29.06 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  25.5 
 
 		 265 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.24 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  44.44 
 
 		 124 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  29.32 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  25.82 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  28.57 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  25.86 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  30.77 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  23.26 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  26.4 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.59 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  27.65 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.06 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  24.26 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  30.54 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  29.41 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  28.06 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  27.38 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  29.15 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  28.74 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.2 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  27.27 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  29.17 
 
 		 467 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  26.25 
 
 		 221 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  29.95 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  35.85 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  28.28 
 
 		 485 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  26.74 
 
 		 476 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  25.98 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  27.27 
 
 		 467 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  21.72 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.17 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4990  LmbE family protein  26.74 
 
 		 467 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  24 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  33.02 
 
 		 245 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  22.55 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  32.78 
 
 		 427 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  24.79 
 
 		 226 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  24.79 
 
 		 226 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  28 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  24.49 
 
 		 227 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  27.53 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4989  hypothetical protein  28.21 
 
 		 478 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  25.2 
 
 		 274 aa  49.3  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  37.37 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  27.06 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  23.7 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  34.41 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  21.29 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  35.8 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  33.02 
 
 		 245 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  22.36 
 
 		 646 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  33.67 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.07 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  26.26 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  25.3 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  28.87 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  25.1 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  24.3 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.37 
 
 		 655 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  26.64 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  27.33 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  24.47 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  31.4 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  24.47 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  27.86 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  31.4 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  29.59 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  24.8 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  26.83 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  22.09 
 
 		 641 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.7 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  22.41 
 
 		 637 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0531  LmbE-like protein  26.21 
 
 		 469 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  27.61 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  35.71 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  23.39 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  24.29 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  23.81 
 
 		 220 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  19.11 
 
 		 657 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  23.67 
 
 		 637 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  25.69 
 
 		 464 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  24.29 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  24.9 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  28.22 
 
 		 258 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66140  hypothetical protein  27.08 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5737  hypothetical protein  27.49 
 
 		 473 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  23.46 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  24.81 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>