176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2921 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  100 
 
 		 264 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  44.34 
 
 		 447 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  42.6 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  40.72 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  38.39 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  38.46 
 
 		 245 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  37.95 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  35.15 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  36.32 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  32.69 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  35.22 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  30.4 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  33.19 
 
 		 462 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  37.97 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  31.56 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  31.8 
 
 		 502 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  31.3 
 
 		 464 aa  89.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  29.2 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  31.5 
 
 		 193 aa  85.9  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  29.88 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  29.92 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  32.65 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  28.47 
 
 		 693 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  29.87 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.69 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  29.22 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  33.33 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  30.65 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  31.73 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  31.08 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.2 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.65 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  29.14 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  31.53 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  30.63 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  35.11 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  31.36 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  33.86 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  25.84 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  23.67 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  25.66 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  34.23 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  25.71 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  25.37 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.3 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.11 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.06 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  27.68 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  31.51 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  31.51 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.14 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  27.19 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  24.61 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  27.83 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  25.52 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  26.37 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.9 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  27.06 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  31.3 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  27.05 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  28.06 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  30.67 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  29.63 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.15 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  27.39 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  35.77 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  32.88 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  23.17 
 
 		 637 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  24.78 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.51 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  27.12 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  42.67 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  26.02 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  29.73 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.39 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.5 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.51 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.23 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  28.98 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  26.88 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  24.82 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  22.32 
 
 		 637 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  43.06 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  27.59 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  26.13 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.73 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  35.56 
 
 		 124 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  24.5 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  27.09 
 
 		 226 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  29.92 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.42 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.56 
 
 		 655 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  32.26 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  25.95 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  24.37 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.23 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.23 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>