173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2160 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  100 
 
 		 292 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  32.23 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  38.61 
 
 		 265 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  40 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  40 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  37.97 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  34.24 
 
 		 244 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  33.17 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  38.26 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  32.13 
 
 		 265 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.23 
 
 		 236 aa  86.3  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  34.64 
 
 		 245 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  30.54 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  29 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  32.17 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  28.57 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  30.17 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  33.15 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  33.71 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  33.52 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  31.76 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  31.76 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  30 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  33.07 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  30.18 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  25.94 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  29.96 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  32.11 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  30.04 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  33.33 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  27.08 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  29.81 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  26.67 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  26.22 
 
 		 693 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  30.32 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  30.72 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  33.12 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  29.36 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  28.12 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  24.83 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  28.4 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  27.19 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  31.54 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  26.67 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  24.29 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  29.27 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  32.34 
 
 		 708 aa  59.3  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  33.58 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  25.97 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  34.15 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  24.03 
 
 		 469 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  28.57 
 
 		 237 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  32.85 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  32.85 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  28.12 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  59.09 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  34.68 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  26.83 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  32.28 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  32.12 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  32.12 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  27.19 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  28.57 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  28.12 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  26.13 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  29.01 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  21.81 
 
 		 487 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  29.71 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  24 
 
 		 220 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  28.47 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  28.48 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  25.23 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  23.6 
 
 		 220 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  23.6 
 
 		 220 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  25.17 
 
 		 248 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  32 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  23.6 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  28.48 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  25.37 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.79 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.14 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  23.69 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  23.69 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  31.54 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  23.69 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  22.8 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  35.14 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  22.8 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  23.69 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  28.84 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  24.63 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.68 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  25.55 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  28.14 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  25.82 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.2 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  25.24 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  27.23 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  23.7 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  31.82 
 
 		 221 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>