249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0402 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  100 
 
 		 217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  85.19 
 
 		 217 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  57.27 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  56.82 
 
 		 220 aa  276  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  56.82 
 
 		 220 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  56.36 
 
 		 220 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  56.82 
 
 		 220 aa  275  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  56.82 
 
 		 220 aa  275  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  56.36 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  56.36 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  56.36 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  56.36 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  53.64 
 
 		 220 aa  268  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  55.86 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  53.46 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  53.24 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  53.24 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  51.82 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  51.36 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  51.82 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  51.82 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  51.36 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  38.95 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  33.04 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  33.64 
 
 		 271 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  33.67 
 
 		 238 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  32.98 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  32.8 
 
 		 270 aa  86.7  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.66 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  30.7 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  31.25 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.58 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.63 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.3 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.84 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  29.65 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  31.53 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  33.74 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  35.14 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  36.05 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  38.57 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  27.27 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  30.2 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  35.66 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  30.48 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  29.65 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  31.63 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  26.44 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  33.58 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  31.21 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.21 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  30.37 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.64 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  25.64 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.84 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.45 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  28.96 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.7 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  30.82 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.9 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  32.92 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.57 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  28.24 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  27.54 
 
 		 292 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  31.65 
 
 		 308 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  31.1 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  30.16 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  32.9 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.32 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  27.08 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.96 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  30.94 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  26.64 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  31.06 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  26.18 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  31.29 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.73 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.89 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  27.96 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  27.08 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  28.22 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.65 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.01 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  29.61 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  29.68 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.19 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26.84 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  31.47 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  33.93 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.29 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  26.11 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.59 
 
 		 484 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  30.91 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.36 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  30.94 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  30.71 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  25.79 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  29.14 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>