230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0604 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  84.16 
 
 
221 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  53.92 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  53.24 
 
 
217 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  49.1 
 
 
226 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  49.1 
 
 
226 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  49.1 
 
 
227 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  48.65 
 
 
227 aa  234  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  48.65 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  49.32 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  48.86 
 
 
220 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  48.86 
 
 
220 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  48.4 
 
 
220 aa  228  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  47.95 
 
 
220 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  48.4 
 
 
220 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  48.4 
 
 
220 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  48.4 
 
 
220 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  48.4 
 
 
220 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  47.95 
 
 
220 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  47.95 
 
 
220 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  44.55 
 
 
229 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  36.51 
 
 
231 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  33.68 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  32.99 
 
 
239 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  33.17 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  31.34 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  31.76 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.75 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  34.81 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.57 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  31.16 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.13 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  31.66 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  29.03 
 
 
299 aa  78.2  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  31.66 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  28.7 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.86 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  32.61 
 
 
309 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  30 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.35 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  32.84 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  31 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.19 
 
 
207 aa  72  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  32.89 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  31.65 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  27.39 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.05 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.5 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  32.61 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.37 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  29.91 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  26.46 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.77 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.9 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.38 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  30.87 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  26.48 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  31.08 
 
 
302 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.3 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  26.8 
 
 
277 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.23 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  29.5 
 
 
277 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  28.78 
 
 
259 aa  62.4  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.72 
 
 
283 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  25.81 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  26.32 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  24.63 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  32.03 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4210  LmbE family protein  31.41 
 
 
298 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.23 
 
 
271 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.7 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  25.44 
 
 
276 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  29.17 
 
 
256 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  30.88 
 
 
302 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  26.06 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.58 
 
 
234 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  24.04 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  25.44 
 
 
308 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  25.44 
 
 
308 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  25.44 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  24.42 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  30.53 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  29.37 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.66 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  30.2 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  26.64 
 
 
268 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  26.8 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  27.23 
 
 
297 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  24.79 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  25.71 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  28.87 
 
 
284 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  27.88 
 
 
308 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  24.88 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  30.34 
 
 
288 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  27.4 
 
 
290 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  27.61 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.66 
 
 
297 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  26.73 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  25.95 
 
 
423 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>