240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2740 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  100 
 
 		 258 aa  530  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  84.46 
 
 		 259 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  57.43 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  49.38 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  46.84 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  50.66 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  48.13 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  44.44 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  48.1 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  41.21 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  35.78 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  37.29 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  36.18 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  39.06 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  39.58 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  39.58 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  37.34 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  34.05 
 
 		 227 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  33.19 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  35.34 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  32.6 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  30.89 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  40 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  33.62 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  34.48 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  32.72 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  33.08 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  36.2 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  36.79 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  34.02 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  36 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  34.67 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.04 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.42 
 
 		 309 aa  92  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  30.68 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  33.99 
 
 		 226 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  33.99 
 
 		 226 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  33.99 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  35.35 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  36.72 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  33.5 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.17 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  32.52 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  39.74 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  31.12 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  31.16 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  31.16 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.8 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  28.93 
 
 		 213 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.65 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  30.8 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  36.76 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  31.52 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  28.86 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  34.96 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  24.26 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  28.44 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  34.78 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  28.57 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  36.76 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30.15 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  29.13 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.29 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  23.93 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  31.62 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.65 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  25.51 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  28.57 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  31.02 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.06 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  31.47 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  34.69 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  32.84 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  34.69 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  30.21 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  34.01 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  28.14 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  28.4 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  31.34 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.64 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.45 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>