256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7997 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  56.61 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  60.43 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  56.28 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  56.09 
 
 		 239 aa  244  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  50.43 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  48.13 
 
 		 258 aa  197  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  45.99 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  40 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  40.69 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  41.63 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  38.86 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  41.95 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  40.74 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  41.7 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  41.81 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  44.98 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  44.16 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  36.55 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  41.81 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  41.74 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  36.63 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  43 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  36.63 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  36.63 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  38.49 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  46.24 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  41.21 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  37.5 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  37.07 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  34.06 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  37.14 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  40 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  34.67 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.25 
 
 		 213 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  36.11 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  32.68 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  32.99 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  32.99 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  30.29 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  31.25 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  33.01 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  28.57 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  32.04 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  32.52 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  34.67 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  32.52 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.54 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  30.29 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  31.63 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  33.84 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30.52 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  30.95 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.73 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  30.24 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  35.57 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  37.72 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  32.46 
 
 		 423 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.86 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  27.78 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.86 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.86 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.86 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.86 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.86 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  29.23 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  29.35 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  29.35 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  44.55 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.36 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.34 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  25.96 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.95 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.89 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  28.81 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.85 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  33 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  27.6 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.63 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  30.1 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  30.65 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  25.41 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.67 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  30.42 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  32.35 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.88 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  31.86 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  28.02 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.47 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  26.67 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>