190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 
240 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  61.61 
 
 
241 aa  249  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  49.11 
 
 
245 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  45.54 
 
 
242 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  47.76 
 
 
241 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  45.3 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  44.14 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  46.22 
 
 
256 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  47.17 
 
 
243 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  47.72 
 
 
239 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  48.46 
 
 
240 aa  151  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  49.25 
 
 
243 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  43.41 
 
 
239 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  41.28 
 
 
243 aa  148  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  51.52 
 
 
244 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  44.16 
 
 
239 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  39 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  33.17 
 
 
231 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  37.05 
 
 
240 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  36.91 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  34.18 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  37.31 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  37.11 
 
 
234 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  39.22 
 
 
423 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  37 
 
 
245 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  36.73 
 
 
242 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  36.41 
 
 
244 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  46.67 
 
 
222 aa  99  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.05 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  99  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  34.78 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  42.75 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.13 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.91 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.61 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  32.22 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  33.5 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  32.62 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  32.62 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  32.62 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  30.11 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.32 
 
 
276 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  28.37 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  30.5 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  31.43 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  33.33 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.37 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  34.27 
 
 
280 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  26.88 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  31.14 
 
 
271 aa  62  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.94 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  26.34 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  30.24 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26.32 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  26.88 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  34.25 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  31.43 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  33.62 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  33.93 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.11 
 
 
308 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  35.71 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  27.42 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  31.62 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  32.24 
 
 
361 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  29.71 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  29.63 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  26.74 
 
 
304 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  25.37 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  33.04 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  23.14 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  38.19 
 
 
350 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  33.33 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  27.19 
 
 
300 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  32.82 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  28.7 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.33 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  26.74 
 
 
930 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  32.14 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  31.88 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  29.88 
 
 
286 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  30.87 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  25.41 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  32 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  22.71 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  29.14 
 
 
923 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  27.52 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>