161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3570 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  64.98 
 
 		 260 aa  351  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  33.79 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  38.61 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  30.4 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  30.8 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  34.84 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  27.51 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  27.63 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  28.57 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  27.63 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  28.51 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  28.09 
 
 		 693 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  28.19 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  28.89 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.68 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.31 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  25.97 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  25 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  28.7 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  27.73 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  24.89 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  27.23 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  27.51 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  31.09 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  26.97 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  29.44 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  32.59 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  31.9 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  31.13 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  31.02 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  24.77 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  28.36 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  24.49 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  29.01 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  25.24 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  30.57 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  25.47 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.06 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  33.09 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  24.26 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.55 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  24.89 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  31.91 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  26.26 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  25 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  29.2 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.23 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.23 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.23 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  25.24 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.23 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.23 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  29.2 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  26.58 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  29.2 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  29.2 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  30.83 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  25.87 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.48 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.25 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  24.62 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  27.14 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  27.59 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.2 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  22.81 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  24.36 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  25.47 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  26 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  21.88 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.15 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  27.7 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  30.07 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  30.58 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  22.47 
 
 		 502 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  24.89 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.17 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  24.5 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.86 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  26.39 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  27.14 
 
 		 471 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  25 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  23.64 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  29.94 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  26.34 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  31.14 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  23.75 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  26.34 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  26.36 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  33.33 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  22.57 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  28.47 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  34.55 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.58 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  25.64 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  24.5 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  26.83 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>