35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1116 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  29.35 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  26.77 
 
 		 693 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  26.87 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  23 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  24.14 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  23.26 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  25 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  36.46 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  26.26 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  23.1 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  33.68 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.12 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  33.7 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  33.33 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  32.63 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  20.19 
 
 		 462 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  32.05 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  30.1 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  23.2 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  32.58 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  29.35 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  30.11 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  30.38 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  32.97 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  30.85 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  26.61 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  29.47 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  33.72 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  28.57 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  26.97 
 
 		 193 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  38.03 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  28.92 
 
 		 427 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  34.72 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.27 
 
 		 207 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>