99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1164 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  88.98 
 
 		 245 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  88.93 
 
 		 245 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  66.39 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  54.32 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  46.94 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  50 
 
 		 244 aa  211  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  44.03 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  39.29 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  39.52 
 
 		 447 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  37.22 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  35.44 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  27.2 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  34.75 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  36.49 
 
 		 462 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  28.71 
 
 		 260 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  29.68 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  36.12 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  37.28 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  36.84 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  28.9 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 		 502 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  32.28 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  33.33 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  33.76 
 
 		 464 aa  82.8  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  30.77 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  32.7 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  34.67 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  33.16 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  35.57 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  31.51 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  33.61 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  34.58 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  33.16 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  28.73 
 
 		 693 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  36.36 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.7 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  25.89 
 
 		 265 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  35.06 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  25.24 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  36.84 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  40 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  33.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  37.23 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  32.17 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.23 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  34.91 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  31.09 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30.4 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  36.48 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  30.22 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 		 708 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  32.74 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  28.7 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  35.71 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  27.75 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  32.63 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  25.6 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  26.67 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  28.12 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  26.02 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  20.99 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  35.22 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  25 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.04 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  30.08 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  27.48 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  26.8 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  33.02 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  47.5 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  29.35 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  34.71 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.27 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  28.99 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  32.8 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  29.01 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  40.23 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  23.2 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  24.48 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  33.71 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  28.31 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.5 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  25.26 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  35.59 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  22.88 
 
 		 637 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  23 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  37.93 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  36 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  44.68 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  37.32 
 
 		 463 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  37.8 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.5 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  31.13 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  23.87 
 
 		 226 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  36.56 
 
 		 369 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  31.52 
 
 		 258 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32.93 
 
 		 244 aa  42  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  20.1 
 
 		 639 aa  41.6  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.513919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>