158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1249 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  54.26 
 
 		 222 aa  258  6e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  47.32 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  43.5 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  43.05 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  44.34 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  43.44 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  37.78 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  39.37 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  37.79 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  40.36 
 
 		 569 aa  157  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  41.63 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  40.27 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  37.9 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  39.37 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  40 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  36.07 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  33.64 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  28.85 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  34.55 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.51 
 
 		 302 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  32.64 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  32.03 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.22 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  28.76 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  31.6 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  31.6 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  31.6 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  31.6 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  30.36 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  29.22 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.83 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.68 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  28.42 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 359 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  26.5 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.2 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.43 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  30.83 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.19 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.19 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  29.96 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.55 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  29.83 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  27.75 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  30.37 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  28.36 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.99 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  29.28 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  30.61 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.14 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.23 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  23.42 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  30.85 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  25.42 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.85 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.88 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  26.52 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  38.1 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  27.46 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  25.85 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.96 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  29.63 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  26.34 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.66 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  31.3 
 
 		 447 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  28.19 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  30.6 
 
 		 358 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  26.45 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  26.99 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.26 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  26.14 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  24.89 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  37.21 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  26.04 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  27.41 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  26.48 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  27.43 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  39.02 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  25.61 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  24.11 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  25.51 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  26 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  28.04 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  22.98 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.2 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.2 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  37.8 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  28.57 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  23.16 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>