272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0497 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  71.05 
 
 		 236 aa  337  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  59.03 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  59.03 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  59.03 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  59.03 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  59.03 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  59.03 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  59.03 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  59.03 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  59.47 
 
 		 234 aa  288  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  59.47 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  59.03 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  40.79 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  38.1 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  39.66 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  36.32 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  38.1 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  38.72 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  37.22 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  40.17 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  37.39 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  34.89 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  34.44 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  38.03 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  37.87 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  39.38 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  38.2 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  35.17 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  36.86 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  38.46 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  37.55 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  39.46 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  39.75 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  34.22 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  34.31 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  35.39 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  32.52 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  31.84 
 
 		 203 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  31.82 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  33.75 
 
 		 250 aa  91.7  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  36.04 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.38 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  30.2 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  33.51 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  32.8 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  30.43 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  28.95 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.4 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  37.1 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  30.37 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  25.76 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  31.16 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  30.51 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.73 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.95 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.17 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  27.73 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.24 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  32.37 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  26.41 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  31.55 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  29.79 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  30.28 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  30.93 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  30.94 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.43 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  31.61 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  31 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.6 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.17 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  30.9 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.54 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  25.86 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  26.52 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  31.36 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  29.59 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.98 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  24.68 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  29.85 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  29.95 
 
 		 358 aa  68.6  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.17 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  29.41 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  30.21 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  23.71 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  27.35 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  26.56 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.87 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  30.57 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.63 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  30.98 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  29.78 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  24.78 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  32.22 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  32.6 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  26.82 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  30.98 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  29.35 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.75 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  28.27 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>