190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1530 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  100 
 
 		 245 aa  513  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  66.26 
 
 		 270 aa  350  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  67.21 
 
 		 247 aa  344  8.999999999999999e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  65.98 
 
 		 249 aa  340  9e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  63.93 
 
 		 250 aa  337  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  63.93 
 
 		 245 aa  333  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  62.7 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  41.74 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  41.18 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  41.03 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  42.01 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  38.63 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  38.46 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  42.31 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  38.89 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  40.42 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  34.33 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  36.32 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  34.65 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  33.47 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  34.06 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  34.06 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  33.33 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  35.81 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  36.04 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  32.5 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  34.8 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  27.66 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  29.73 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  27.43 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  31.64 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  32.28 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.11 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  27.59 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  30.2 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.27 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.27 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  27.27 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.27 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  30.37 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  29.02 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.02 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.16 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.66 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  31.88 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  34.92 
 
 		 358 aa  68.6  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  27.75 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  27.66 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.23 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  29.45 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.22 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.29 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.07 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  28.76 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.66 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  27.27 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  24.12 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.57 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  24.03 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.25 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  22.89 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  26.7 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  30.99 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  28.03 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  28.57 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  26.21 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  25.62 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  24.08 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  24.24 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  26.69 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.36 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  32.03 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  26.23 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  26.27 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  23.04 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  27.5 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  32.21 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  25.53 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.02 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  24.79 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  29.83 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  25.11 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  25.13 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  26.61 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  25.13 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  30.2 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  28.44 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  23.44 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  27.06 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  28.85 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>