258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0589 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  100 
 
 
265 aa  511  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  36.32 
 
 
231 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  37.95 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  38.17 
 
 
227 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  38.14 
 
 
243 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  35.18 
 
 
240 aa  96.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  33.67 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  34.72 
 
 
239 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  41.43 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  33.16 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  33.54 
 
 
213 aa  89  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  35.9 
 
 
234 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  36.13 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  35.23 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  34.06 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  34.85 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  34.78 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  32.98 
 
 
250 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  34.86 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  38.3 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.93 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  38.92 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.93 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  36.88 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  33.33 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.9 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  31.8 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  34.92 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  41.79 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  30.7 
 
 
359 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.5 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  33.68 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  30.48 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  33.16 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  37.93 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  36.36 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  33.05 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  27.96 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  38.39 
 
 
244 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  35.61 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.65 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  37.17 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  34.52 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  35.23 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.43 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  38.97 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.65 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  31.43 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  31.97 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  33.01 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  31.89 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  34.62 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  32.11 
 
 
203 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  34.88 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  32.49 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  35.08 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  29.21 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  35.38 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  35.29 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  41.67 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  31.38 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  37.19 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  29.78 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  33.7 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  40.15 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  32.84 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  32.84 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  32.84 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  32.84 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  30.84 
 
 
221 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
359 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  32.18 
 
 
223 aa  62.4  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  33.1 
 
 
222 aa  62  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  32.26 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  36.09 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  29.81 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  34.12 
 
 
193 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.77 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  37.04 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.18 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.72 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.57 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  35.46 
 
 
256 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  32.03 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  32.29 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  28.4 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  24.61 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.26 
 
 
234 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  37.38 
 
 
222 aa  58.9  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  31.58 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.37 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>