More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_873 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  497  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  94.09 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  93.25 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  46.91 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  45.5 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  44.04 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  43.59 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  43.59 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  42.11 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  41.36 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  45.08 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  44.56 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  39.38 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  38.22 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  37.34 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  42.49 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  39.79 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  36.63 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  39.58 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  39.06 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  37.17 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  40.62 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  34.16 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  35.79 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  31.58 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  34.39 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  34.21 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  31.96 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  36.68 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  30.8 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  31.58 
 
 		 423 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  32.72 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  32.07 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  32.46 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  34.59 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  32.83 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  32.98 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  32.46 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  31.41 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  31.94 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  31.94 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  31.94 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  31.94 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  31.94 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  31.94 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  33.33 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  30.89 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  31.94 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  36.64 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  32.49 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  32.09 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  32.95 
 
 		 309 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  32.99 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  33.12 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  34.83 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  30.69 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.9 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  30.2 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  38.46 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.34 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  39.72 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  31.44 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  32.5 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  30.69 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  29.9 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30.73 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  31.77 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  31.82 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  29.53 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  34.85 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  31.07 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  33.16 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  30.73 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  29.95 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.84 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  29.95 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  29.82 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.95 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.95 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.95 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.95 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  32.81 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  29.47 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.47 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  28.8 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.16 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  26.64 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  29.53 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  27.88 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  30.57 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  27.88 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  28.57 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.99 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  27.88 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  28.87 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  29.35 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.74 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  30.39 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  30.93 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>