162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0048 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  36.91 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  32.9 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.95 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  30.51 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  31 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.45 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.56 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  29.18 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.57 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.22 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.02 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.59 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  29.58 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  27.75 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.59 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.71 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  25.74 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.97 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  25.32 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.17 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  30.53 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  24.36 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  31 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  25.96 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  25.62 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  29.96 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  27.78 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30.4 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.2 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  26.7 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  30.86 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.33 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  27.13 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  28.21 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25.53 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  25 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  29.19 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  27.9 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.27 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.2 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.2 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.2 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  29.66 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.2 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.2 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.2 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  29.57 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.75 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  28.4 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  26.27 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  28.9 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  28.88 
 
 		 221 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  27.57 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.44 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  29.05 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  28.14 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  28.35 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  29.53 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  25.21 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  24.57 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  26.44 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  27.13 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  26.38 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  30.43 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.98 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  26.38 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  29.76 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  27.9 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.61 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  29.8 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  24.79 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  30.15 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  22.98 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  27.59 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  24.38 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  27.71 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  26.61 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  26.7 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  28.07 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  29.39 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  30.56 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  25.4 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  24.38 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  27.67 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  27.13 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  24.69 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  25.45 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  25.45 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  24.46 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  25.45 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  25.51 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 350 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  27.73 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  34.55 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>