152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2405 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  61.54 
 
 		 423 aa  255  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  45.96 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  45.15 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  44.22 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  46.6 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  43.22 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  43.69 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  40.72 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  39.27 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  37.39 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  41.95 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  39.9 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  34.59 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  34.05 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  34.78 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  31.37 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  45.52 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  35.18 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  34.23 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  39.1 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  28.45 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  29.57 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  30.69 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  31.31 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.79 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  31.28 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.04 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  31.84 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.87 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.87 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  38.53 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  44.55 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.2 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  30.23 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  36.07 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  31.62 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  31.62 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  26.8 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  31.62 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  27.57 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.89 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  29.18 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.93 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.41 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  28.29 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.87 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  37.8 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  25.56 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  32.85 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  27.62 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  24.04 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  24.04 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26.82 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  28.49 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  22.87 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  27.83 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  29.79 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  22.77 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  35.45 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  28.15 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  28.49 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  25.71 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  27.27 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  31.39 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  27.83 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  25.13 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  23.27 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  27.55 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  35.96 
 
 		 311 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  36.63 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  23.81 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  36 
 
 		 302 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  27.46 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.05 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  26.92 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  38.64 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  23.47 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  26.4 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  28.85 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  25.27 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  23.47 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.17 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  27.27 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  30.39 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  24.73 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  25.63 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>