134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3433 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  100 
 
 		 251 aa  513  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  35.68 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  38.1 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  36.29 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  36.91 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  36.89 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  37.77 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  37.23 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  34.44 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  38.7 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  36.55 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  32.27 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  32.23 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  36.84 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  36.48 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  35.81 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  35.81 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  38.05 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  32.66 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  34.96 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  37.55 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  33.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  33.89 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  33.2 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  35.42 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  33.61 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.93 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  31.78 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.96 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.4 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  28.51 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  28.1 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  27.69 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  28.14 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.97 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  28.16 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  32.88 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.42 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  32.46 
 
 		 245 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  28.71 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28.86 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  28.02 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  26.67 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  34.06 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.74 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.51 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  26.94 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.59 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  22.37 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  30.29 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.9 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  24.62 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  24.64 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.85 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  26.34 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  25.37 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  27.05 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  24.53 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  24.79 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  25.2 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  28.24 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  24.48 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  27.27 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  26.4 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  32.54 
 
 		 218 aa  52.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  28.5 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  28.99 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  30.83 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  26.44 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  25.63 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.21 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  27.71 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  26.13 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  35.25 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  26.09 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  28.69 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  31.16 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.21 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  25.21 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.21 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  25.25 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  26.54 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.41 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  21.9 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  22.69 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  26.6 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.1 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  26.53 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.2 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>