196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0942 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  100 
 
 		 270 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  65.04 
 
 		 249 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  65.73 
 
 		 250 aa  353  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  66.26 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  65.27 
 
 		 247 aa  346  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  65.16 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  61.16 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  41.6 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  39.42 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  39.5 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  40.34 
 
 		 238 aa  188  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  38.66 
 
 		 243 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  42.41 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  38.91 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  37.13 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  41.67 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  35.29 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  34.69 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  38.1 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  34.25 
 
 		 237 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  30.7 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  31.88 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  35.81 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  30.26 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  31.88 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  32.6 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  33.77 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  30.57 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  29.75 
 
 		 240 aa  92  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  28.51 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  27.41 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  33.14 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  26.24 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.09 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.41 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  25.97 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  33.92 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  27.78 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.91 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.42 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.97 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.97 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  25.97 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.97 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.97 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  24.89 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.47 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.89 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  28.8 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.05 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  26.11 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  28.44 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  28.32 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  31.58 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  25.81 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  26.82 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  32.58 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  23.25 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  31.22 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  31.15 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  23.97 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  31.82 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.74 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  25.43 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  29.94 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  34.33 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  23.29 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.17 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  21.52 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  24.1 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28.41 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  29.67 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  29.71 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  27.32 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.82 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  25.91 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  26.64 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  33.33 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  25.74 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  25.64 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  25.63 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  35.25 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  25 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  26.11 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  28.39 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.77 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  27.52 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  26.02 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  25.1 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  24.75 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  24.76 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  21.3 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>