132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0201 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  66.1 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  57.2 
 
 		 238 aa  291  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  51.46 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  50.43 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  44.81 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  45.61 
 
 		 245 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  44.63 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  44.63 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  44.63 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  44.96 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  45.65 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  45.53 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  45.38 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  44.96 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  44.96 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  41.28 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  32.03 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.13 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  32.65 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  39.72 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  31.07 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.27 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.21 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.57 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  29.61 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.39 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  33.33 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.5 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  28.93 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  30.25 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  29.74 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  27.62 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  29.41 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  26.21 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.03 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  30.3 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  28.86 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  30.1 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  30.42 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  33.5 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  26.75 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  28.88 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  26.8 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  27.27 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.32 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  27.69 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  30.96 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  25.52 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  29.31 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26.83 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  29.15 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.54 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.29 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  23.43 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  27.5 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  24.37 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.09 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.09 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  30.1 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25.43 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.61 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  25.54 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.14 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  24.37 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  30.32 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.59 
 
 		 302 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  28.09 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.39 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  26.64 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  27.62 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  26.8 
 
 		 569 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  28.97 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.51 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 359 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.73 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  25.21 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  23.6 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  27.85 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.2 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  29.14 
 
 		 358 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  27.91 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  24.55 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  28.28 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  31.15 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  28.97 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  27.05 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  27.8 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  23.69 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  23.86 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  26.3 
 
 		 299 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>