145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1232 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  40.37 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  44.08 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  28.57 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  28.99 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  31.42 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  32.57 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  29.77 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  29.65 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  29.49 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  32.88 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  31.9 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  27.01 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  28.85 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  27.15 
 
 		 569 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  30.95 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  26.63 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  28.02 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  30.14 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  26.46 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.64 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  25 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  23.74 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  24.23 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  24.37 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  22.39 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  24.77 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  25.21 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  26.52 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  25 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  22.28 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  24.06 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  25.68 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  27.56 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.72 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.09 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.12 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  23.44 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  25.52 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  24.61 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  25.91 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  26.13 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  22.67 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  23.44 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  23.44 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  23.44 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  22.28 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  23.44 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  23.44 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  23.81 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  23.71 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  26.15 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  25.27 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  25.88 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  23.78 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  24.61 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  24.61 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  24.48 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.13 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  22.92 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  28.57 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.49 
 
 		 492 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  25.89 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  22.97 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  25.93 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  29.32 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  24.35 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  24.35 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  25.62 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  22.75 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  27.18 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  25.95 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  23.96 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  23.56 
 
 		 299 aa  51.6  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  23.47 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  23.47 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  23.47 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  23.47 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  23.47 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  19.34 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  24.12 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  23.47 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  23.59 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  24.1 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  25.83 
 
 		 427 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  25.71 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  25.9 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  22.96 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  27.13 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  25.55 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  21.6 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  26.34 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  25.51 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  22.42 
 
 		 276 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  20.92 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  43.75 
 
 		 693 aa  48.5  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  25.93 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  22.76 
 
 		 462 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  25.2 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>