135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  57.02 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  53.23 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  52.32 
 
 		 245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  52.74 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  52.74 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  52.74 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  52.65 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  52.28 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  51.44 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  51.65 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  51.24 
 
 		 244 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  50.2 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  49.13 
 
 		 237 aa  228  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  50.43 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  44.26 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  40 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  31.15 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  31.28 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.6 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.12 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.66 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  35.98 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  24.68 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  32.67 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.99 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.35 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  32.1 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.69 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.91 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  33.33 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  29.11 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  31.74 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  26.41 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.64 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.64 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.96 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  31.63 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  25 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  28.22 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  27.08 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  26.38 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  27.39 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  28.95 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  27.84 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  27.84 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.23 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.16 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  26.14 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  27.83 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  28.99 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  26.27 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  27.32 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  26.29 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  30.77 
 
 		 358 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.31 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.16 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  26.04 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  25.62 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  23.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  30.23 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  20.92 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  27.08 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  28.1 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  24.88 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  28.99 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.2 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  26.05 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  27.92 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  28.86 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  23.71 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  25.12 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  25.42 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  26.29 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  26.29 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  26.29 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  24.48 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  27.5 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  24.88 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.32 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  27.24 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  26.29 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  30.4 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.39 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  27.21 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.83 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.83 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  33.33 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  30.43 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  26.29 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  28.57 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  25.13 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.25 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  27.94 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>