More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2558 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
492 aa  996    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  28.36 
 
 
613 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  28.36 
 
 
623 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  28.36 
 
 
613 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 
613 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 
613 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  28.36 
 
 
613 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.07 
 
 
236 aa  72  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  28.86 
 
 
613 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  33.59 
 
 
1171 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 
957 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  35.25 
 
 
1165 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  35.25 
 
 
1165 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.17 
 
 
207 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
573 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.17 
 
 
326 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
303 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  30.3 
 
 
221 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 
853 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
853 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0928  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
311 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
364 aa  60.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
289 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 
853 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  27.46 
 
 
236 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  31.82 
 
 
204 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
1486 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
597 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  30.35 
 
 
221 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
1250 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
296 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
370 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1152 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
331 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  25.79 
 
 
249 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1152 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
326 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
305 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.15 
 
 
234 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.15 
 
 
234 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.15 
 
 
234 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.65 
 
 
326 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
308 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.15 
 
 
234 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.15 
 
 
234 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  33.15 
 
 
237 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.68 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  24.7 
 
 
237 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
851 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
851 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
851 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
581 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  29.63 
 
 
851 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.65 
 
 
326 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.01 
 
 
270 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
333 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.26 
 
 
310 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
254 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
318 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 
280 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
318 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  23.9 
 
 
234 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
235 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25.38 
 
 
234 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  24.6 
 
 
218 aa  54.7  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  23.91 
 
 
225 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  30.46 
 
 
257 aa  54.7  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
746 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  31.33 
 
 
250 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  24.53 
 
 
234 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
322 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  22.49 
 
 
223 aa  53.5  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1747  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
270 aa  53.5  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  24.53 
 
 
234 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.67 
 
 
326 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  33.05 
 
 
785 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  24.05 
 
 
234 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
851 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
289 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  30.77 
 
 
313 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
230 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  29.92 
 
 
740 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  26.26 
 
 
225 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
326 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 
337 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  22.73 
 
 
227 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
303 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.06 
 
 
294 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
337 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
544 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
327 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
235 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  25.15 
 
 
349 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
333 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
313 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
324 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>