97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1370 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  100 
 
 		 204 aa  423  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.16 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.99 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  35.42 
 
 		 231 aa  72  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  30.11 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.94 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.49 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  31.02 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.72 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  31.95 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.39 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  30.6 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  28.51 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.68 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.82 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.51 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  26.14 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  29.07 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.25 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.49 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  27.63 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.8 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  24.66 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  30.52 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  23.89 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.26 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  30.27 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  26 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.11 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  32.8 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  29.92 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.55 
 
 		 280 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  26.88 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.74 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.45 
 
 		 302 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  24.18 
 
 		 261 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  28.8 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  25.29 
 
 		 286 aa  51.6  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  25.81 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  24.34 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  24.24 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.57 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  24.73 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  26.92 
 
 		 447 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.08 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  31.94 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  25.77 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.78 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  24.49 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  23.74 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  23.44 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  29.82 
 
 		 288 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  22.03 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  26.96 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  32.22 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  23.43 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  24.28 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  24.28 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  24.28 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  29.75 
 
 		 655 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.98 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.98 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  23.98 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  28.42 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25.14 
 
 		 254 aa  44.7  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.98 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  24.62 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.98 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25.93 
 
 		 637 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  37.5 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  28.18 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  27.27 
 
 		 423 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  27.5 
 
 		 264 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  22.41 
 
 		 308 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  27.68 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.67 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  24.61 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  25.47 
 
 		 502 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  26.96 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  22.83 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  33.03 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  23.7 
 
 		 646 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  21.9 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  29.06 
 
 		 249 aa  41.6  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.19 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  31.9 
 
 		 239 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  21.17 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>