80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1010 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  100 
 
 		 469 aa  964    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  31.52 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  37.89 
 
 		 693 aa  207  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  37.73 
 
 		 322 aa  163  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  30.88 
 
 		 337 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  30.88 
 
 		 300 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  32.33 
 
 		 316 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.92 
 
 		 265 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  27.83 
 
 		 277 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  27.85 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  26.45 
 
 		 265 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  29.35 
 
 		 289 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  28.36 
 
 		 288 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  42 
 
 		 124 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.97 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  24.48 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  29.1 
 
 		 244 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  24.9 
 
 		 207 aa  65.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  23.67 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  36.46 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  37.89 
 
 		 245 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  37.89 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  28.32 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  25.35 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  36.84 
 
 		 245 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  24.81 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  37.63 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  24.03 
 
 		 292 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  25.69 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  25.31 
 
 		 252 aa  53.5  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  24.8 
 
 		 217 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  24.62 
 
 		 227 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  33.68 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  38.14 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  24.82 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  33.68 
 
 		 257 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  25.26 
 
 		 221 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  35.87 
 
 		 193 aa  50.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  23.44 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  24.48 
 
 		 464 aa  50.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  31.63 
 
 		 253 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  23.2 
 
 		 502 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  26.56 
 
 		 227 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25.93 
 
 		 243 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  26.32 
 
 		 229 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.34 
 
 		 655 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  31.58 
 
 		 637 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  34.78 
 
 		 244 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  27.37 
 
 		 221 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  32.99 
 
 		 227 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  26.82 
 
 		 369 aa  46.6  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  27.27 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  27.27 
 
 		 226 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  27.27 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  23.17 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  31.19 
 
 		 708 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  32.97 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  27.62 
 
 		 281 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  26.07 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  25.61 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  31.58 
 
 		 260 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.79 
 
 		 231 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  34.57 
 
 		 277 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  33 
 
 		 243 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  29.03 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  38.78 
 
 		 237 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  26.35 
 
 		 302 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  22.22 
 
 		 220 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.07 
 
 		 244 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.89 
 
 		 237 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  22.53 
 
 		 221 aa  43.5  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  22.53 
 
 		 221 aa  43.5  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  32.61 
 
 		 245 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.33 
 
 		 274 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  22.22 
 
 		 220 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  26.13 
 
 		 487 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>