97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1028 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  100 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  62.13 
 
 		 316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  59.54 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  36.33 
 
 		 693 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  32.89 
 
 		 487 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  30.88 
 
 		 469 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  35.27 
 
 		 337 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  31.1 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.63 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  29.85 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.96 
 
 		 207 aa  93.2  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  45 
 
 		 124 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  28.06 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  30.51 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  23 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  24.14 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  29.93 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30.28 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  30.54 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  26.97 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  35.35 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  28.14 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  25.93 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.34 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  30.67 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.29 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  21.64 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  34.68 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  25.61 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  30.73 
 
 		 476 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  38.71 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1285  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  23.32 
 
 		 655 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  36.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  23.39 
 
 		 234 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  23.64 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  30.6 
 
 		 485 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25.27 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  28.35 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  26.79 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  30 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  29.61 
 
 		 467 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25.27 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25.27 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  33.94 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25.27 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25.27 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  27.84 
 
 		 502 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  28.74 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  25.62 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  29.31 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  35.78 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4990  LmbE family protein  29.05 
 
 		 467 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  24.19 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  34.74 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4989  hypothetical protein  27.39 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  23.63 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  27.31 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  24.7 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  28.79 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  27.75 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  32.66 
 
 		 487 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  28.34 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  28.4 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.03 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  24.58 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  26.02 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  26.02 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  26.02 
 
 		 227 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  27.81 
 
 		 467 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.21 
 
 		 657 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.56 
 
 		 655 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  19.02 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  24.26 
 
 		 212 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  24.58 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  23.72 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  34.58 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  26.67 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  28.04 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.56 
 
 		 646 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  31.62 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  34.74 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  24.6 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25.98 
 
 		 639 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.1 
 
 		 670 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0531  LmbE-like protein  28.79 
 
 		 469 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.1 
 
 		 642 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  26.74 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  35.11 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  33.02 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  32.02 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  22.54 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  23.64 
 
 		 642 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.35 
 
 		 637 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  20.47 
 
 		 207 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>