228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5415 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1285  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  50.48 
 
 
655 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  56.85 
 
 
639 aa  780    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  62.64 
 
 
641 aa  866    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  60.8 
 
 
637 aa  826    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  77.95 
 
 
646 aa  1051    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
657 aa  1373    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  59.49 
 
 
637 aa  799    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  67.62 
 
 
642 aa  912    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  58.85 
 
 
670 aa  803    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  58.37 
 
 
642 aa  794    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  60.61 
 
 
647 aa  812    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  49.3 
 
 
655 aa  621  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.45 
 
 
642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  53.78 
 
 
303 aa  265  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.59 
 
 
242 aa  207  6e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  48.93 
 
 
260 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.57 
 
 
264 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.46 
 
 
268 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.28 
 
 
259 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.73 
 
 
241 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.21 
 
 
256 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.8 
 
 
256 aa  195  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.19 
 
 
263 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.19 
 
 
268 aa  193  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.86 
 
 
279 aa  193  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.04 
 
 
251 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.87 
 
 
249 aa  192  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.44 
 
 
242 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.81 
 
 
260 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.21 
 
 
242 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.04 
 
 
253 aa  191  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.11 
 
 
250 aa  190  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.02 
 
 
242 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.44 
 
 
262 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.62 
 
 
268 aa  188  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.44 
 
 
260 aa  187  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.33 
 
 
252 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.9 
 
 
253 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.3 
 
 
265 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.04 
 
 
260 aa  180  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.62 
 
 
266 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.73 
 
 
261 aa  178  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.2 
 
 
270 aa  177  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 
244 aa  176  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.23 
 
 
276 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.69 
 
 
263 aa  173  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.3 
 
 
236 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.04 
 
 
245 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  42.67 
 
 
339 aa  171  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.24 
 
 
277 aa  171  6e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.63 
 
 
266 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.91 
 
 
266 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  40.24 
 
 
358 aa  167  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.48 
 
 
266 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.59 
 
 
233 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.15 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.59 
 
 
247 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.39 
 
 
261 aa  165  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.07 
 
 
266 aa  165  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.55 
 
 
266 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.55 
 
 
266 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.33 
 
 
268 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.55 
 
 
266 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.55 
 
 
266 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.55 
 
 
266 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.26 
 
 
259 aa  164  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.25 
 
 
266 aa  164  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.22 
 
 
233 aa  164  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.39 
 
 
260 aa  163  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.26 
 
 
240 aa  163  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.44 
 
 
261 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3128  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.02 
 
 
266 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1203  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.62 
 
 
266 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.48 
 
 
262 aa  162  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.04 
 
 
262 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.04 
 
 
262 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.04 
 
 
262 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.04 
 
 
262 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.04 
 
 
262 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.04 
 
 
262 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.04 
 
 
262 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.57 
 
 
266 aa  160  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.49 
 
 
266 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.48 
 
 
262 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.26 
 
 
261 aa  160  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.59 
 
 
262 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.26 
 
 
266 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62706  Glucosamine-6-phosphate isomerase (Glucosamine-6-phosphate deaminase) (GNPDA) (GlcN6P deaminase)  38.55 
 
 
252 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.68 
 
 
266 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.6 
 
 
270 aa  157  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.26 
 
 
268 aa  156  9e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.01 
 
 
233 aa  156  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>