95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3554 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  100 
 
 		 337 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  36.64 
 
 		 693 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  36.27 
 
 		 487 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  30.88 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  35.27 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  35.04 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  31.29 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  28.72 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  43.14 
 
 		 124 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  28.79 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.55 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  26.69 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  26.04 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  41 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.07 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  24.83 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  40 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  40 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.47 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.51 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.51 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.76 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  27.05 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.38 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  35.65 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  27.12 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  36.84 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  25.29 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  27.44 
 
 		 427 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  31.43 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  30 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.97 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  33.01 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.88 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  23.34 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  35.35 
 
 		 447 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  37.5 
 
 		 464 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25.9 
 
 		 642 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  24.59 
 
 		 231 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  35.05 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  25.82 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  24.32 
 
 		 502 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  25.42 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  35.92 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  24.02 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.15 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  46.15 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  34.48 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  30.19 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  51.28 
 
 		 237 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.74 
 
 		 642 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25 
 
 		 639 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  47.37 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  29.65 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  34.34 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 657 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.02 
 
 		 637 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1285  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  23.89 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  24.91 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  44.19 
 
 		 646 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  28.26 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  38 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  38 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  45.45 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.54 
 
 		 218 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1078  LmbE family protein  26.25 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0142184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.43 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  32.26 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  24.18 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  22.03 
 
 		 637 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  26.55 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25.57 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  26.52 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  25.99 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  25.44 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  25.93 
 
 		 485 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5737  hypothetical protein  24.66 
 
 		 473 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  26.22 
 
 		 467 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  24.81 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  26.67 
 
 		 476 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  31.31 
 
 		 464 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.86 
 
 		 641 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  39.02 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  24.29 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  25 
 
 		 248 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>