61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1078 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1078  LmbE family protein  100 
 
 		 258 aa  487  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0142184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1075  LmbE family protein  94.57 
 
 		 258 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  86.86 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  41.48 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2069  LmbE family protein  41.7 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.512905  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0441  LmbE family protein  42.13 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  35.71 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7836  LmbE family protein  39.91 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  37.78 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  28.72 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  26.25 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  28.86 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  36.36 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  25.95 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  25.87 
 
 		 693 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  30.3 
 
 		 292 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  34.83 
 
 		 427 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.09 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  28.88 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  25.71 
 
 		 487 aa  48.9  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.61 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  30.86 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  31.82 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  30.41 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  32.24 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.76 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  25.56 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  27.34 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  30.99 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.59 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  30.15 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  30.53 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  28.74 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  22.57 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  31.72 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  27.5 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  30.05 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  24.66 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  32.17 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  31.47 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  32.19 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  31.47 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  22.33 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  30.82 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  40.65 
 
 		 464 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  31.25 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30.13 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  28.08 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  27.4 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  28.68 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  32.06 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  19.61 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  30.35 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.34 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  32.09 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  28.85 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.1 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  25.96 
 
 		 265 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  29.73 
 
 		 316 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>