22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0441 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0441  LmbE family protein  100 
 
 		 285 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2069  LmbE family protein  86.13 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.512905  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  41.48 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1078  LmbE family protein  41.99 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0142184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1075  LmbE family protein  43.36 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  40.95 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7836  LmbE family protein  38.34 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  30.83 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  31.55 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  32.83 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  32.68 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  39.1 
 
 		 427 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  32.65 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  32.49 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  31.94 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  29.03 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  33.33 
 
 		 462 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  30.58 
 
 		 464 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  29.17 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  32.69 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  33.14 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  30.08 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>