105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3132 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  80.93 
 
 		 257 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  60.08 
 
 		 252 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  52.24 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  50.78 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  49.61 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  50.39 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  52.07 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  49.79 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  37.6 
 
 		 286 aa  168  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  45.02 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  40.32 
 
 		 462 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  39.75 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  35.83 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  36.22 
 
 		 464 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  33.47 
 
 		 502 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  35 
 
 		 464 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  33.9 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  33.76 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  33.05 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  31.74 
 
 		 471 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  36.08 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  34.96 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  34.98 
 
 		 708 aa  87.8  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  34.02 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  33.49 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  29.87 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  33.71 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  33.14 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  33.85 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.03 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  33.49 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0905  hypothetical protein  31.28 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  32.09 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  33.33 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  25.93 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  29.55 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  28.38 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  24.9 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7836  LmbE family protein  31.87 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  24.66 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  30.52 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2069  LmbE family protein  35.35 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.512905  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  30.15 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  31.25 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.89 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  27.43 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.57 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  28.67 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  29.78 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.01 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  30.19 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  34.75 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  24.05 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  30.23 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  21.32 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  29.58 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.48 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  30.33 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.37 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  26.15 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  29.37 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.89 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  32.12 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  32.12 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  25.96 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  31.88 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.25 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  31.17 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  28.57 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  24.06 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  32.65 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.97 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  29.13 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.37 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  29.37 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  29.37 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  28.36 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  32.65 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  32.65 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  32.65 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  29.37 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  24.06 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  29.69 
 
 		 358 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  30 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  26.04 
 
 		 693 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  25.93 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  28.17 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0441  LmbE family protein  31.12 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  30.6 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  25.55 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  26.8 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  27.97 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  22.86 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  37.29 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  25.45 
 
 		 250 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>